La mostra è articolata in due sezioni principali, I PRIMI LINCEI e LA BIBLIOTECA.

La prima sezione è dedicata alla storia della prima Accademia dei Lincei, presentata attraverso i testi di botanica realizzati per l’opera enciclopedica sulla natura ideata da Federico Cesi (fondatore dell’Accademia), i taccuini di viaggio scritti e illustrati da un altro dei fondatori, l’olandese Johannes van Heeck, e numerosi manoscritti tuttora conservati nell’Archivio Linceo, contenenti fra l’altro le prescrizioni per i primi soci e le loro firme autografe, tra le quali quella di Galileo Galilei.

La seconda sezione è divisa in sette sottosezioni, alcune delle quali, a loro volta, composte da più parti: I. Araldica; II. Ozi dilettevoli ed eruditi; III. Le Lettere: Antichi, Moderni, Islam; IV. I Templari; V. Dal testo sacro al libro di preghiera: la Bibbia e il Corano, Il Commento e l’interpretazione, La Liturgia, La Devozione; VI. Le Scienze: La Natura, Scienze esatte, Alchimia, Il disegno tra scienza e tecnica; VII. Il libro chiuso.